细胞图谱问世
细胞图谱问世 《自然》7月19日发表的3篇论文报道了肠道、肾脏和母胎界面的参考细胞图谱。除了这些研究,人类生物分子图谱计划(HuBMAP)还在《自然》子刊上发表了一系列论文。这些工作揭示了各类型细胞排列以及它们与不同组织和器官相互作用的新信息,是研究生物学和疾病的宝贵资源。 对人类来说,细胞的组织方式和细胞间的相互作用决定了器官和组织的功能。HuBMAP计划旨在绘制整个的细胞排列方式,帮助科学家研究细胞如何工作,以及细胞间的关系如何影响个体健康。为此,HuBMAP合作组一直在开发能在单细胞水平上绘制组织和器官内细胞分子组成空间图谱的工具,这些组成包括RNA、蛋白质和代谢物。这类工具已被用来构建人类肠道、肾脏以及与胎盘相连组织的参考细胞图谱。 美国加州斯坦福大学医学院的Michael Snyder和同事研究了肠道,从消化到支持免疫系统,这个复杂的器官有许多不同的结构和功能。研究人员分析了9名个体的8个肠道部位,揭示了不同位置肠道组成的巨大差异。作者发现了新的上皮细胞亚型,还发现了不同细胞类型会形成“社区”,有些“社区”能特异性地调节免疫应答。研究结果揭示了能促进肠道发挥功能的复杂、差异化的细胞组成。 美国密苏里州圣路易斯华盛顿大学医学院的Sanjay Jain和同事分析了45个健康的和48个生病的肾脏。这些器官的损伤会触发肾细胞变化,最终影响肾脏功能。作者绘制了肾脏不同区域的51种主要细胞类型的单细胞和空间图谱。他们还发现了会在急性或慢性损伤下改变的细胞状态和肾脏免疫细胞、基质细胞和上皮细胞“社区”,包括与修复途径是否成功或存在缺陷有关的状态。 斯坦福大学的Michael Angelo和同事构建了妊娠前半期的胎盘图谱。研究人员分析了来自66例母胎界面样本的约50万个细胞和588个动脉,这里是母体和胎盘细胞共同为胎儿提供生命支持的位置。具体而言,他们研究了胎盘和子宫之间的界面,这里的母体动脉会发生改变,从而给胎儿供血。这些图谱覆盖了妊娠6-20周的不同发育阶段,识别了胎盘和免疫细胞之间的相互作用;后一项发现阐明了母体免疫细胞如何支持母体和胎儿完全不同的细胞共存。 英国剑桥惠康桑格研究所的Roser Vento-Tormo和Roser Vilarrasa-Blasi在一篇同时发表的新闻与观点文章中写道,“这3个HuBMAP图谱……通过定义与疾病相关的细胞状态的空间位置,有望推动我们对疾病的理解。”他们预计将来还会有来自其他组织的更多图谱,并指出仍需检验更多样本来“建立细胞组织和功能在健康和疾病中的可靠关联”。 相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41586-023-05915-x https://doi.org/10.1038/s41586-023-05769-3 https://doi.org/10.1038/s41586-023-06298-9