美研究团队通过全基因组重建技术预测胚胎疾病风险
人类生殖辅助技术(ART)是以体外受精-胚胎移植(IVF-ET)为基础的一项辅助不育夫妇妊娠的技术，IVF-ET也就是我们常说的“试管婴儿”。当前，IVF-ET已发展到第三代，帮助了无数不育夫妇实现妊娠愿望，并且凭借着能够检测遗传缺陷的优势，在提高人口素质方面也做出了重要贡献。 “第一代IVF-ET”是将母体中取出的卵子放置在培养皿中，再选择经过优选诱导获能处理的精子，让他们在实验室一起孵育，以形成胚胎，该技术主要针对的是女性排卵障碍而引起的不孕。“第二代IVF-ET”是采用卵泡浆内单精子显微注射(ICSI)形成胚胎的技术，该技术主要针对的是因男性因素的导致的不育。 “第三代IVF-ET”即植入前胚胎基因检测(PGT)，指的是在胚胎移植前，对其进行基因检测或染色体数目及结构异常的检测，并选择性地植入正常胚胎，自PGT被引入ART以来，它有效地减少了试管婴儿的出生缺陷，也被认为是ART中提高妊娠成功率最有效的手段之一。 PGT能够对植入前的胚胎进行家族特异性遗传疾病的分析，如孟德尔疾病、心脏病、癌症等，然而这些由于单细胞或少细胞胚胎活检中DNA的数量和质量有限，因此，全面胚胎基因组分析耗时长且十分昂贵，这也阻碍了基因中罕见有害变体的检测。 近期，美国MyOme公司的研究团队在《Nature Medicine》上发表的一项研究成果“Whole-genome risk prediction of common diseases in human preimplantation embryos”表示，该公司的研究团队成功扩展了全基因组重建(WGR)策略，通过使用亲本基因组测序和胚胎基因分型来预测胚胎的遗传基因组序列，并以此来预测常见疾病的发生风险。 研究人员表示，该项研究设计重建来自10对夫妇的110组胚胎基因组，利用分子和统计技术的组合来评估胚胎将来患癌症、心脏代谢和自身免疫性疾病等常疾病的患病风险，将胚胎的重建基因组和多基因预测与相应出生儿童的组织样本产生的预测进行比较。 研究结果显示，WGR方法能够预测胚胎基因组中的罕见和常见变异，证明了WGR在植入前胚胎基因检测的可行性，该技术的重建结果还能够精确计算多基因风险评分(PRS)。与出生的孩子相比，全基因组预测的准确性范围从第3天胚胎活检的96.3-98.4%到第5天胚胎活检的98.0-98.9%。 来源：《Nature Medicine》、科技部
